Morsi a fost condamnat la moarte în iunie 2015, fiind acuzat că a fi făcut înțelegeri secrete cu militanți străini pentru a organiza evadarea în masă a islamiștilor aflați în închisoare, acțiune ce a avut loc în timpul revoluției din 2011.
În anul 2012 acesta a devenit primul președinte ales în mod democratic, după revoluția din 2011. În urma protestelor masive împotriva conducerii sale, Morsi a fost înlăturat de la putere în 2013 de către generalul și actualul Președinte al Egiptului, Abdel Fattah al-Sisi.
Acesta a fost arestat la scurt timp după ce a fost destituit și a primit două condamnări la închisoare pe viață pentru spionaj în favoarea grupului palestinian Hamas și divulgarea unor secrete de stat.
Verdictul Curții egiptene semnifică faptul că Morsi nu mai riscă să fie executat. Cinci alți membri ai Frăției Musulmane, condamnați de asemenea la moarte, au fost și ei cruțați.