A fost un membru marcat al PNL și a ocupat mai multe funcții importante de-a lungul celor 11 ani cât a fost pe scena politică din România.
Într-un sondaj realizat în 2005, Mona Muscă și Traian Băsescu împărțeau locul întâi în preferințele românilor, deputatul liberal bucurându-se de o foarte bună încredere din partea a 47% dintre respondenți.
La doar un an distanță, a venit și decăderea. Pe 8 august 2006, Lavinia Șandru a declarat public că Mona Muscă a colaborat cu Securitatea și că dosarul ei a ajuns pe masa CNSAS.
Biroul Permanent Central al PNL a decis pe 14 august 2006, fără să aștepte verdictul CNSAS, să-i retragă sprijinul politic și, o lună mai târziu, pe 2 septembrie, a fost dată afară din partid.
Inițial, ea a susținut că nu a făcut „nici măcar o secundă” poliție politică, pentru ca apoi să recunoască faptul că, în 1977, la Timișoara, a semnat, ca profesor, un angajament cu Securitatea, care viza oferirea de informații necesare siguranței studenților străini. Fără să facă scandal, Muscă a plecat elegant și s-a ocupat de lucruri obișnuite. S-a restras departe de București, într-o căsuță din Caraș-Severin și a putut fi văzută de-a lungul timpului rar la anumite evenimente culturale: lansări de film sau carte.
În 2010, a fost printre susținătorii lui Teo Trandafir care, la acea vreme, a candidat la un loc de deputat pentru PDL. A fost una dintre rarele apariții legate de politică ale Monei Muscă.